- Proporcionar un mejor conocimiento de los beneficios de la psicoterapia, dirigiendo sus esfuerzos tanto a los profesionales de la salud como a la población en general.
- Fomentar la investigación en psicoterapia e incrementar la calidad en la formación y práctica de la misma.
- Generar intercambio científico entre los psicoterapeutas de la región a través de actividades, encuentros reuniones de las diferentes asociaciones que componen FLAPSI.
- Promover la inclusión de todos los países de AL, que aun no forman parte de la Federación , manteniendo el respeto por las diferentes escuelas y corrientes psicoterapéuticas de base científica, a través de la creación de Asociaciones locales en cada país y cooperando en el fortalecimiento de las ya existentes.